阿莫西林膠囊是常用的抗生素藥物。臨床上該藥發生不良反應的情況，與藥品使用說明書中的介紹基本相符：臨床應用的不良反應極低，偶有腹瀉、惡心、嘔吐等胃腸道反應及皮疹。
 
在家庭使用阿莫西林膠囊的患者中，時有皮疹等過敏反應發生，個別人的過敏癥狀還比較嚴重，說明阿莫西林在放置過程中仍有可能發生分解與聚合等化學變化，形成新的過敏性雜質，而保存于家庭中的藥物在炎熱潮濕的季節里變質失效的速度會加快。不少人放置藥物如同對待雜物，哪里方便放哪里。如果將阿莫西林置于離爐灶、暖氣等熱源較近的地方，就容易發生變質。有人放在家中的阿莫西林膠囊已臨近失效期了，保存條件又不好，服用后出現過敏反應并不奇怪。目前，藥品的生產物流方式日益科學化，工廠生產的藥品能很快到達患者的手中。倉儲條件好了，倉儲時間短了，更利于保證藥品的質量。家中缺乏長期保存藥物的條件，有可能造成有效期內的阿莫西林膠囊引起過敏反應。
 
有些地方曾頻繁出現過阿莫西林膠囊引起嚴重過敏反應的現象，并有致死病例發生。這種現象引起了醫藥界的關注，說明嚴格規范阿莫西林膠囊生產、銷售和使用的必要性。中國藥典和國家衛生行政部門規定使用阿莫西林前須進行皮膚過敏性試驗。家庭不具備進行青霉素過敏性皮試的條件，自行服用阿莫西林膠囊時，對可能出現的藥物過敏反應難以防范。因此，使用阿莫西林膠囊應遵醫囑，將其作為家庭常備藥物自行服用既有盲目性，也有危險性。
 
使用阿莫西林膠囊免皮試的做法在醫療衛生單位至今仍較普遍，在有些藥店也可以直接購得該藥。但藥品質量因生產廠家的生產和技術條件不同而參差不齊，存在過敏反應的風險不可忽視。醫院藥房、藥店和患者都應選擇聲譽好的阿莫西林膠囊產品。對青霉素過敏的患者應慎用或不用阿莫西林膠囊。經國家有關部門批準后上市的免皮試阿莫西膠囊及其他口服青霉素類藥品今后會逐步得到普及，但也不宜久存于家中和隨意使用。