甲亢的藥物治療包括抗甲狀腺藥物及輔助藥物治療。

抗甲狀腺藥物治療甲亢分三個階段：

一是癥狀控制階段;二是減量階段;三是維持階段。甲亢的療程較長，在病情控制后尚需持續一年半至兩年。少年患者療程更長。持續服藥的效果較斷續服藥為佳，復發的機會較少。

一、抗甲狀腺藥物 抗甲狀腺藥物常用的藥物主要有兩類：

1.硫脲類 如他巴唑、甲亢平、甲基硫氧嘧啶及丙基硫氧嘧啶等。

臨床上應用較多的是他巴唑，其次是丙基硫氧嘧啶。由于丙基硫氧嘧啶除了能抑制甲狀腺激素合成外，尚可在外周阻斷T4脫碘轉化成T3，一般認為T3是甲狀腺激素活性部分，T4的生物活性作用很低，通常轉化成T3后起作用，因此T4向T3轉化受抑制，對治療有利，就這一點來說，丙基硫氧嘧啶優于其他三種藥，通常在甲亢危象時應首選該藥。甲亢平的作用類似他巴唑，在體內甲亢平轉化成他巴唑后才起作用。甲基硫氧嘧啶和丙基硫氧嘧啶結構類似。

2.咪唑類 有甲巰咪唑、卡比馬唑等。

適應癥：①病情輕，甲狀腺較小者;②年齡在20歲以下，孕婦、年邁體弱或合并嚴重心、肝、腎等病而不宜手術者;③術前準備;④甲狀腺次全切除后復發而不宜用131碘治療者;⑤作為放射性131碘治療前后的輔助治療。

二、其他藥物治療

1.復方碘溶液 僅用于術前準備和甲狀腺危象。其作用是減少甲狀腺充血，減少和抑制甲狀腺激素的合成和釋放，但屬暫時性。于給藥后2~3周內癥狀減輕，而以后，又可使甲亢癥狀加重，并影響抗甲狀腺藥物的療效。

2.普奈洛爾 不僅作為β-受體阻滯劑用于甲亢初期治療，而且還有阻抑T4轉換成T3的作用，近期改善癥狀療效顯著。此藥可與碘劑等合用于術前準備，也可用語131碘治療前后及甲狀腺危象時。但哮喘病人禁用。還有阿替洛爾、美托洛爾。

在治療過程中，患者應堅持按醫囑服藥，不可任意中止，除非有明顯的停藥指癥，可以在醫生的指導下停藥。患者應支持隨診，在治療過程中遵醫囑調整劑量。如劑量過大，可引起甲狀腺功能減退，反而使甲狀腺腫大，并對突眼不利，如劑量過小，則甲亢不能控制。

在抗甲狀腺藥物治療過程中的常有一些毒副反應發生，需引起注意。較常見的反應為皮疹，大多較輕微，有的病人只有瘙癢，常在最初數周發生，在持續服藥過程中消失，偶爾可發展成嚴重的剝脫性皮炎，因此仍需重視，必要時減量，換藥或停藥。

最嚴重的毒性反應為粒細胞缺乏癥，多發生在用藥1-8周，伴有高熱，喉痛，偶有腹痛。故在開始服藥后，應每周檢查白細胞計數天分尖1-2次，如有發熱，喉痛應立即與醫生聯系，作白細胞檢查。甲亢患者粒細胞往往偏低，在用藥后，粒細胞進一步減低，但在大多數情況下，粒細胞經一段時間降低后，又會上升至正常。

一般來說，如白細胞計數低于3000/立方毫米或粒細胞低于1500/立方毫米，應考慮停藥。少數患者粒細胞減少越來越嚴重，可能發展為粒細胞缺乏。粒細缺乏癥一旦發生，必須立即停藥，患者恢復后也不可再用同類的藥物治療，抗甲狀腺藥物對肝臟有損傷作用，特別是原有肝臟損傷的患者需慎用，一般在治療前后應檢查肝功能，有嚴重肝損者應停藥。